KLASIFIKASI GLIKOSILASI PADA SEQUENCE PROTEIN LISIN MENGGUNAKAN METODE RANDOM FOREST

Silfia , Fitriyana (2023) KLASIFIKASI GLIKOSILASI PADA SEQUENCE PROTEIN LISIN MENGGUNAKAN METODE RANDOM FOREST. FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM, UNIVERSITAS LAMPUNG.

Preview	Text 1. ABSTRAK-ABSTRACT.pdf Download (6kB) | Preview
	Text 2. SKIRPSI FULL.pdf Restricted to Repository staff only Download (4MB) | Request a copy
Preview	Text 3. SKRIPSI TANPA BAB PEMBAHASAN.pdf Download (3MB) | Preview

Abstract

Glikosilasi pada sequence protein lisin proses pengklompokkan protein lisin yang terglikosilasi ke dalam kelompok-kelompok berdasarkan jenis glikosilasi yang terdapat pasa protein lisin. Klasifikasi glikosilasi pada sequence protein lisin dengan menggunakan metode random forest, tujuan dari penelitian ini untuk menganalisa sensitivitas, spesifisitas, akurasi, dan matthew correlation coefficient (MCC). Dataset protein lisin diperoleh dari data benchmark memiliki jumlah protein 620 dengan 214 data positif dan 406 data negatif serta memiliki panjang protein 15 sequence. Dataset dibagi menjadi 2, yaitu 90% data latih dan 10% data uji. Ekstraksi fitur yang digunakan protein descriptor menggunakan R package BioSeqClass versi 1.44.0, yaitu AA Index, CTD, dan PseAAC, dengan jumlah total 60 fitur. Hasil yang didapatkan diolah kembali menggunakan klasifikasi algoritme random forest dengan mtry 4, 8, dan 16 lalu ntree dipilih secara acak 250, 500, 750, dan 1000. Hasil yang didapatkan paling tinggi didapatkan pada pembagian dataset 90% data latih 10% data uji dengan mtry 42 ntree 1000 sebesar 89.97% sensitivitas, 92.79% spesifisitas, 80.76% MCC, dan 90.42% akurasi. Hasil yang didapatkan menggunakan ekstraksi fitur dan algoritme random forest bisa mengklasifikasikan protein lisin. Kata Kunci : Glikosilasi, protein lisin, fitur ekstarksi, klasifikasi, random forest

Item Type:	Other
Subjects:	?? 500 ??
Divisions:	Fakultas MIPA > Prodi Ilmu Komputer
Depositing User:	2301569738 . Digilib
Date Deposited:	02 Mar 2023 06:52
Last Modified:	02 Mar 2023 06:52
URI:	http://digilib.unila.ac.id/id/eprint/70018

Actions (login required)

View Item