SELEKSI MARKA Simple Sequence Repeats (SSR) UNTUK MENGANALISIS KERAGAMAN GENETIK VARIETAS UNGGUL KOPI ROBUSTA (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) di PARUNGKUDA, KABUPATEN SUKABUMI, JAWA BARAT

Elisabeth, Christella Vanessa Jayanti (2026) SELEKSI MARKA Simple Sequence Repeats (SSR) UNTUK MENGANALISIS KERAGAMAN GENETIK VARIETAS UNGGUL KOPI ROBUSTA (Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) di PARUNGKUDA, KABUPATEN SUKABUMI, JAWA BARAT. FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM, UNIVERSITAS LAMPUNG.

Preview	Text ABSTRAK.pdf Download (270kB) | Preview
	Text SKRIPSI FULL.pdf Restricted to Repository staff only Download (1MB) | Request a copy
Preview	Text SKRIPSI FULL TANPA BAB PEMBAHASAN.pdf Download (1MB) | Preview

Abstract

Kopi Robusta memiliki keragaman genetik yang tinggi karena sifatnya menyerbuk silang. Keragaman ini penting untuk mendukung program pemuliaan dan pengembangan varietas unggul melalui analisis genetik yang akurat pada tingkat DNA. Kualitas dan kuantitas DNA hasil ekstraksi sangat menentukan keberhasilan analisis genetik. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui kuantitas dan kualitas DNA dari 25 varietas unggul kopi Robusta menggunakan metode isolasi KIT Promega dan CTAB serta menguji keberhasilan amplifikasi dengan primer SSR. Hasil NanoDrop menunjukkan metode CTAB menghasilkan DNA dengan kuantitas dan kemurnian lebih tinggi sebagian besar berada antara 1,7–2 dibandingkan KIT Promega. Elektroforesis gel agarosa menunjukkan DNA dari KIT Promega membentuk smear, sedangkan beberapa sampel CTAB tidak membentuk pita jelas akibat kehilangan pelet atau kontaminasi. Uji PCR dengan 28 primer SSR menunjukkan hanya DNA hasil CTAB yang berhasil diamplifikasi; 12 primer menghasilkan pita pada 25 varietas unggul yang mengindikasikan adanya polimorfisme genetik. Hasil ini menunjukkan bahwa metode CTAB lebih efektif untuk ekstraksi DNA kopi Robusta dalam analisis molekuler berbasis SSR. Kata kunci: Coffea canephora, keragaman genetik, Simple Sequence Repeats (SSR), Varietas

Item Type:	Other
Subjects:	?? 500 ?? ?? 570 ??
Divisions:	?? biologi_terapan ??
Depositing User:	2605062121 Digilib
Date Deposited:	04 Jun 2026 07:30
Last Modified:	04 Jun 2026 07:30
URI:	http://digilib.unila.ac.id/id/eprint/99877

Actions (login required)

View Item