<> "The repository administrator has not yet configured an RDF license."^^ . <> . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS"^^ . "Telah dilakukan analisis dinamika molekul protein lysozyme putih telur yang\r\ndiselimuti air bentuk kubik dengan variasi temperatur 300 K, 325 K, dan 350 K\r\nserta melakukan perhitungan nilai energi potensial dengan persamaan Lennard\r\nJones yang dilakukan dengan aplikasi Gromacs. Pada temperatur 300 K\r\nmenunjukan nilai tekanan 2,54 bar dan nilai densitas 997,54 kg/m3 serta terjadi\r\nperubahan unfolded state di rantai asam amino ARG21-CA dan SER81-CA yang\r\nmenghasilkan energi potensial 2992,14 kJ/mol. Pada temperatur 325 K\r\nmenunjukan nilai tekanan 4,84 bar dan nilai densitas 974 kg/m3 serta terjadi\r\nperubahan unfolded state di rantai asam amino ASP101-CA dan GLN121-CA\r\nyang menghasilkan energi potensial 2994,55 kJ/mol. Pada temperatur 350 K\r\nmenunjukan nilai tekanan 0,82 bar dan nilai densitas 948,747 kg/m3 serta terjadi\r\nperubahan unfolded state di rantai asam amino ARG21-CA dan menghilangnya\r\nrantai asam amino GLN121-CA yang menghasilkan energi potensial 2999,65\r\nkJ/mol. Hasil Root Mean Standart Deviation (RMSD) menunjukan bahwa protein\r\nmulai terdenaturasi pada temperatur 350 K yang ditandai pemutusan rantai asam\r\namino GLN121-CA sejauh 0.07 nm.\r\nKata kunci: dinamika molekul, Lennard-Jones, lysozyme, Gromacs.\r\nThe molecular dynamic analysis of lysozyme protein has been done using\r\nGromacs application. Lysozyme protein filled by water in the cubic form with\r\nvariation of temperature was 300 K, 325 K, and 350 K and calculated potential\r\nenergy values used Lennard Jones equation. Structure protein on temperature\r\nwas 300 K showed that pressure value was 2,54 bar and density value was 997,54\r\nkg/m3\r\nthen protein changed in unfolded state on ARG21-CA and SER81-CA\r\namino acid chain with potential energy was 2992,14 kJ/mol . Structure protein on\r\ntemperature was 325 K showed that pressure value was 4,84 bar and density\r\nvalue was 974 kg/m3\r\n\r\nthen protein changed in unfolded state on ASP101-CA and\r\nGLN121-CA amino acid chain with potential energy was 2994,55 kJ/mol.\r\nStructure protein on temperature was 350 K showed that pressure value was 0,82\r\nbar and density value was 948,747 kg/m3\r\n\r\nthen protein changed in unfolded state\r\non ARG21-CA amino acid chain and lost on GLN121-CA amino acid chain with\r\npotential energy was 2999,65 kJ/mol. Root Mean Standard Deviation (RMSD)\r\nshowed that the protein will be denaturated on temperature 350 K caused by lost\r\non GLN121-CA amino acid with distance was 0.07 nm.\r\nKeywords: molecular dynamics, Lennard-Jones, lysozyme, Gromacs."^^ . "2019" . . . . . "FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM"^^ . . . . . . . "1417041030"^^ . "HARRY PRAYOGA"^^ . "1417041030 HARRY PRAYOGA"^^ . . . . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (File PDF)"^^ . . . "ABSTRAK (ABSTRACT).pdf"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (File PDF)"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (File PDF)"^^ . . . "SKRIPSI TANPA BAB PEMBAHASAN.pdf"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "indexcodes.txt"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "indexcodes.txt"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "lightbox.jpg"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "preview.jpg"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "medium.jpg"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "small.jpg"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "lightbox.jpg"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "preview.jpg"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "medium.jpg"^^ . . . "ANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH\r\nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES\r\nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS (Other)"^^ . . . . . . "small.jpg"^^ . . "HTML Summary of #57470 \n\nANALISIS DINAMIKA MOLEKUL PROTEIN LYSOZYME PUTIH \nTELUR DENGAN MODEL POTENSIAL LENNARD-JONES \nMENGGUNAKAN APLIKASI GROMACS\n\n" . "text/html" . . . "500 ilmu pengetahuan alam dan matematika" . . . "530 Fisika" . .