title: KERAGAMAN MORFOLOGI DAN GENOTIPIK BERDASARKAN  MARKA RAPD SERTA PERBANYAKAN VEGETATIF DENGAN  STEK PADA SEJUMLAH GENOTIPE KOPI ROBUSTA    (Coffea canephora Pierre ex A Froehner)    DI LAMPUNG
creator: SRI RAMADIANA, 1534171002
subject: 600 Teknologi (ilmu terapan)
subject: 630 Pertanian dan teknologi yang berkaitan
description: Kopi Robusta (Coffea canephora Pierre ex A Froehner) yang dibudidayakan di  Lampung memiliki produktivitas yang tertinggi kedua di Indonesia setelah Sumatera  Selatan, dengan hasil sebesar 831kg/ha/th dan lebih besar dari rata-rata produktivitas  kopi Indonesia (716 kg/ha/th). Akan tetapi produktivitas kopi Lampung ini jauh lebih  rendah dibandingkan produktivitas kopi negara Brazil (3.346 kg/ha/th) dan Vietnam  (1.781 kg/ha/th). Penyebab utama rendahnya produktivitas kopi di Lampung adalah  terkait dengan teknik budidaya, penyediaan bibit unggul dan program pemuliaan kopi  yang belum terarah. Peningkatan produktivitas kopi di Lampung dapat dilakukan  dengan, pertama, mengidentifikasi karakter morfologi dan genetiknya untuk  mengetahui tingkat kekerabatannya. Selanjutnya, kedua, berdasarkan tingkat  kekerabatannya, dapat dipilih genotipe-genotipe untuk ditanam bersama-sama dalam  sistem budidaya poliklonal untuk mendapatkan produktivitas yang tinggi. Sistem  budidaya poliklonal dari klon kopi unggul Lampung harus didukung oleh ketersediaan  bibit dalam jumlah banyak dan bermutu. Penyediaan bibit dalam jumlah besar dapat  dilakukan dengan menggunakan perbanyakan vegetatif melalui stek cabang ortotrop.  Penelitian ini bertujuan untuk a) mengidentifikasi dan mengkarakterisasi morfologi kopi  robusta (Coffea canephora) unggul Lampung; b) menentukan keragaman genetik klon  kopi Robusta unggul lokal dan nasional di Lampung menggunakan marka RAPD; c)  mendapatkan teknik perbanyakan klonal kopi Robusta yang efisien melalui penggunaan  zat pengatur tumbuh IBA dan NAA. Hasil penelitian menunjukkan bahwa terdapat  kesamaan karakter morfologi pada beberapa genotipe tertentu dari 15 genotipe yang  dievaluasi. Tugu Sari memiliki panjang daun yang hampir sama dengan genotipe dari  Kabupaten Tanggamus seperti Tugino, Wanto, dan Biyadi. Tiga genotipe dari  Tanggamus (Tugino, Wanto dan Biyadi) memiliki diameter batang yang lebih lebar  dibandingkan genotipe unggul nasional. Dilihat dari karakteristik biji, genotipe kopi  dari Tanggamus secara umum menghasilkan biji yang lebih panjang, lebih tebal dan  lebih berat dibandingkan dengan biji yang dihasilkan oleh genotipe dari Kabupaten  Lampung Barat. Tingkat kemurnian DNA hasil ekstraksi menggunakan nitrogen cair  lebih tinggi daripada tingkat kemurnian DNA hasil ekstraksi menggunakan teknik  perendaman dengan etanol absolut 96%. Terdapat 11 primer terseleksi yang digunakan  dalam reaksi PCR yaitu OPE-18, OPI-07 OPN16, OPG-03, OPR1, OPL18, OPM13,  OPN18, OPO15, OPO12 dan OPO5. Kondisi PCR yang optimal pada penelitian ini  yaitu satu siklus denaturasi awal pada suhu 940C selama 3 menit diikuti 30 siklus yang  terdiri dari denaturasi pada suhu 940C selama 1menit, annealing pada suhu 370  C  selama 1 menit, dan ekstensi pada 720C selama 2 menit, lalu diikuti dengan ekstensi    xxiii    akhir pada 720C selama 10 menit. Reaksi dilakukan pada volume 25 μl dalam tabung  reaksi 200 μl yang berisi 50 ng templat DNA, 12,5 μl kit PCR (Qiagen), 2 μl primer,  dan sisanya adalah akuades steril. Analisis RAPD menggunakan 11 primer  menunjukkan adanya variasi jumlah pita polimorfik dan ukuran fragmen DNA yang  teramplifikasi. Kemiripan genetik antargenotipe Robusta yang digunakan dalam  penelitian ini berkisar antara 25,6% - 93%. Berdasarkan jarak genetiknya, genotipe  Blirik, Imam 1, BP 913, BP 203, dan BP 534 berpotensi untuk dijadikan tetua  persilangan untuk mendapatkan efek heterosis. Pemberian auksin IBA 1000 ppm  menyebabkan peningkatan persentase stek berakar, jumlah akar, panjang akar, dan  jumlah tunas. Pemberian IBA 1000 ppm pada genotipe Komari dan Tugino  menghasilkan tunas yang lebih panjang daripada genotipe lainnya yang dicoba. yaitu  8,72-9,08 cm; (2) Jenis auksin, yaitu IBA, NAA atau kombinasi (IBA+NAA) tidak  berpengaruh terhadap persentase stek berakar, jumlah akar, panjang akar, dan panjang  tunas, tetapi berpengaruh terhadap bobot kering akar. Perlakuan (IBA+NAA)  menghasilkan bobot kering akar yang lebih tinggi dibandingkan perlakuan IBA atau  NAA saja. Kombinasi (IBA+NAA) 2000 ppm menghasilkan bobot kering akar  tertinggi. Konsentrasi auksin 1000 dan 2000 ppm menyebabkan peningkatan  pembentukan dan pertumbuhan tunas dengan hasil terbaik pada 2000 ppm. The productivity of Robusta coffee (Coffea canephora Pierre ex A Froehner) cultivated  in Lampung (831 kg/ha/yr) came second to that of South Sumatera, being higher than  the average coffee productivity in Indonesia (716 kg/ha/yr). However, coffee  productivity in Lampung is lower than that of Brazil (3,346 kg/ha/yr) and Vietnam  (1,781 kg/ha/yr). This low productivity is related to cultivation techniques, seed quality  and coffee breeding programs. To increase coffee productivity is firstly to determine  genetic relatedness among coffee clones in Lampung based on genetic and  morphological characters, and secondly to select clones to be used in polyclonal  cultivation which results in high productivity. The polyclonal cultivation must be  supported by the availability of good quality planting materials such as cuttings from  orthotropic branches. This study aimed to a) conduct morphological characterization of  superior Robusta coffee (Coffea canephora) in Lampung; b) determine the genetic  diversity among local and national superior clones of Robusta coffee cultivated in  Lampung based on RAPD markers, c) obtain an efficient clonal propagation of Robusta  coffee by cuttings using plant growth regulators IBA and NAA. It was found that  certain genotypes showed similar morphological characters among 15 Robusta coffee  genotypes. Tugu Sari was found to have leaf length that was almost the same as that of  genotypes from Tanggamus Regency such as Tugino, Wanto, and Biyadi. Three  genotypes from Tanggamus (Tugino, Wanto and Biyadi) had wider stem diameters than  the national superior genotypes. Judging from the characteristics of the beans, coffee  genotypes from Tanggamus generally produced coffee beans that were longer, thicker  and heavier than those from West Lampung Regency. The purity of DNA extracted  using liquid nitrogen was better than DNA extracted using the immersion technique  with 96% absolute ethanol. There were 11 selected primers used in PCR reaction,  namely OPE-18, OPI-07 OPN16, OPG-03, OPR1, OPL18, OPM13, OPN18, OPO15,  OPO12 and OPO5. The optimal PCR condition was as follows: one cycle of initial  denaturation at 94°C for 3 minute followed by 30 cycles of denaturation at 94°C for 1  minute, annealing at 37°C for 1 minute, and extension at 72°C for 2 minutes. The final  extension was done at 72°C for 10 minutes. The PCR reaction was done in a volume of  25 μl in a 200-μl microtube containing 12.5 μl of PCR kit (QIAGEN), 50 ng of DNA  template and 2 μl of a random primer. DNA analysis using 11 RAPD markers showed  variations in the number of polymorphic bands and the size of amplified products. The  genetic similarity among the Robusta genotypes used in this study ranged from 25.6% -  93%. Based on their genetic distance, the genotypes of Blirik, Imam 1, BP 913, BP 203,  and BP 534 had the potential to be used as parents in a breeding program to get    xxv    heterosis effects. The application of 1000 ppm IBA resulted in increased rooting  percentage, root number, root length and shoot number. Application of 1000 ppm of  IBA to the Komari and Tugino genotypes resulted in the highest shoot length (8.72-9.08  cm). Types of auxins (IBA, NAA or IBA+NAA) had no effects on root formation and  shoot growth, but had effects on root dry weight. The treatment of (IBA+NAA) led to  higher root dry weight than that of IBA or NAA alone. Auxin concentrations of 1000  and 2000 ppm led to an increase in the formation and growth of shoots, the best  concentration being 2000 ppm.
publisher: FAKULTAS PERTANIAN
date: 2021
type: Disertasi
type: NonPeerReviewed
format: text
identifier: http://digilib.unila.ac.id/62163/1/ABSTRAK%20-%20Atalah%20Printing_10.pdf
format: text
identifier: http://digilib.unila.ac.id/62163/2/DISERTASI%20FULL%20-%20Atalah%20Printing.pdf
format: text
identifier: http://digilib.unila.ac.id/62163/3/DISERTASI%20TANPA%20PEMBAHASAN%20-%20Atalah%20Printing_3.pdf
identifier:   SRI RAMADIANA, 1534171002  (2021) KERAGAMAN MORFOLOGI DAN GENOTIPIK BERDASARKAN MARKA RAPD SERTA PERBANYAKAN VEGETATIF DENGAN STEK PADA SEJUMLAH GENOTIPE KOPI ROBUSTA (Coffea canephora Pierre ex A Froehner) DI LAMPUNG.  [Disertasi]     
relation: http://digilib.unila.ac.id/62163/