?url_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Adc&rft.title=KLASIFIKASI+DNA-BINDING+PROTEIN+MENGGUNAKAN+ALGORITME+RANDOM+FOREST&rft.creator=RIDHO+ALRAFI%2C+1817051009&rft.subject=005+Pemrograman+komputer%2C+program+dan+data&rft.subject=500+ilmu+pengetahuan+alam+dan+matematika&rft.description=Mengklasifikasikan+fungsi+protein+dan+struktur+dari+urutan+adalah+salah+satu+tantangan+penting+untuk+kombinasi+biologi.+Urutan+protein+masih+susah+untuk+diklasifikasikan+karena+semakin+beragamnya+protein+yang+ditemukan%2C+dan+juga+banyaknya+metode+yang+bisa+digunakan+untuk+menentukan+urutan+protein.+Pada+penelitian+ini+berfokus+terhadap+protein+pengikat+DNA.+Protein+pengikat+DNA+memainkan+peran+penting+dalam+beberapa+bagian+besar+proses+seluler.+Oleh+karena+itu%2C+perlu+dilakukannya+pengklasifikasian+untuk+mengidentifikasi+protein+pengikat+DNA+berdasarkan+urutan+protein+menggunakan+ekstrasi+fitur+dan+random+forest.+Tujuan+dari+penelitian+ini+untuk+menganalisa+sensitivitas%2C+spesifisitas%2C+akurasi%2C+dan+matthew+correlation+coefficient+dari+protein+pengikat+DNA.+Dataset+protein+pengikat+DNA+diperoleh+dari+PDB+(Protein+Data+Bank)+dengan+mencari+kata+kunci+%E2%80%9CDNA-binding+protein%E2%80%9D%2C+memiliki+jumlah+protein+1075+dengan+525+data+positif+dan+550+data+negatif+serta+memiliki+panjang+protein+terpendek%2C+yaitu+51+amino+acids.+Dataset+dibagi+menjadi+2%2C+yaitu+80%25+data+latih+20%25+data+uji+dan+90%25+data+latih+10%25+data+uji.+Ekstraksi+fitur+yang+digunakan+protein+descriptor+menggunakan+R+package+BioSeqClass+versi+1.44.0%2C+yaitu+AAIndex%2C+CTD%2C+dan+PseAAC%2C+dengan+jumlah+total+440+fitur.+Hasil+yang+didapatkan+diolah+kembali+menggunakan+klasifikasi+algoritme+random+forest+dengan+mtry+10%2C+21%2C+dan+42+lalu+ntree+dipilih+secara+acak+100%2C+250%2C+500%2C+dan+1000.+Hasil+yang+didapatkan+paling+tinggi+didapatkan+pada+pembagian+dataset+90%25+data+latih+10%25+data+uji+dengan+mtry+42+ntree+1000+sebesar+89.97%25+sensitivitas%2C+92.79%25+spesifisitas%2C+80.76%25+MCC%2C+dan+90.42%25+akurasi.+Hasil+yang+didapatkan+menggunakan+ekstraksi+fitur+dan+algoritme+random+forest+bisa+mengklasifikasikan+protein+pengikat+DNA.&rft.publisher=FAKULTAS+MIPA&rft.date=2022-07-27&rft.type=Skripsi&rft.type=NonPeerReviewed&rft.format=text&rft.identifier=http%3A%2F%2Fdigilib.unila.ac.id%2F65702%2F1%2FABSTRAK.pdf&rft.format=text&rft.identifier=http%3A%2F%2Fdigilib.unila.ac.id%2F65702%2F2%2FSKRIPSI%2520FULL.pdf&rft.format=text&rft.identifier=http%3A%2F%2Fdigilib.unila.ac.id%2F65702%2F3%2FSKRIPSI%2520FULL%2520TANPA%2520BAB%2520PEMBAHASAN.pdf&rft.identifier=++RIDHO+ALRAFI%2C+1817051009++(2022)+KLASIFIKASI+DNA-BINDING+PROTEIN+MENGGUNAKAN+ALGORITME+RANDOM+FOREST.++FAKULTAS+MIPA%2C+UNIVERSITAS+LAMPUNG.+++++&rft.relation=http%3A%2F%2Fdigilib.unila.ac.id%2F65702%2F