title: OPTIMASI ANALISIS SNP (Single Nucleotide Polymorphism) GEN Disease  Resistance Proteins RPS2 GENOM JAGUNG (Zea mays L.) 8 VARIETAS  FASE PERKECAMBAHAN BERBASIS PCR (Polymerase Chain Reaction)
creator: Riski , Ade Soleh 
subject: 630 Pertanian dan teknologi yang berkaitan
description: Jagung merupakan komoditas pangan kedua utama di Indonesia setelah padi.  Kebutuhan jagung terus meningkat setiap tahunnya. Namun, budidaya tanaman  jagung masih mengalami berbagai kendala yang salah satunya ialah serangan  hama. Sejak tahun 2019, terdapat hama baru yang menyerang tanaman jagung.  Hama ini dikenal dengan Fall Armyworm (FAW) atau hama ulat grayak  (Spodoptera frugiperda). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui ketahanan 8  varietas tanaman jagung terhadap serangan ulat grayak, serta mengoptimasi  kondisi PCR terhadap marka SNP Gen Disease Resistance Protein RPS2 8  varietas tanaman jagung. Analisis dilakukan pada tanaman jagung dengan 8  varietas, yaitu varietas NK7328, Pertiwi 5, BISI 321, BISI 18, Pionner 36, NK  Super, Eksotik, dan Lokal. Pengujian terhadap intensitas serangan ulat grayak  menggunakan Rancangan Acak Kelompok dengan 4 ulangan, dengan analisis Uji  Anara dan Uji Duncun taraf signifikansi 5% menggunakan Rstudio. Varietas yang  tahan terhadap intensitas serangan ulat grayak secara berturut-turut yaitu varietas  BISI 321, Pertiwi 5, Pionner 36, NK 7328, Lokal, BISI 18, NK Super, dan  Eksotik. Analisis DNA menggunakan tanaman jagung usia 7 HST, sampel  diekstraksi menggunakan metode kit Promega dengan konsentrasi dan kemurnian  DNA hasil ≥ 800 ng/μl dan 1,8, secara berturut- turut. Desain Primer marka SNaP  Gen Disease Resistance Protein RPS2 berdasarkan perangkat lunak  WebSNAPPER. Terdapat 2 pasang primer yang akan digunakan. Optimasi PCR  dilakukan pada suhu annealing, waktu annealing, dan volume template DNA.  Hasil amplifikasi divisualisasi dengan metode capillary electrophoresis digital.  Kondisi optimum pasangan primer 1 dengan target amplifikasi varietas BISI 321  yaitu suhu annealing 52°C dan waktu annealing selama 5 detik. Sedangkan  kondisi optimum pasangan primer 3 dengan target amplifikasi varietas NK7328  yaitu suhu annealing 52°C , waktu annealing selama 5 detik, dan volume template  DNA 0,4 μl.
publisher: FAKULTAS PERTANIAN
date: 2023-08-07
type: Skripsi
type: NonPeerReviewed
format: text
identifier: http://digilib.unila.ac.id/75236/1/ABSTRAK.pdf
format: text
identifier: http://digilib.unila.ac.id/75236/2/SKRIPSI%20FULL.pdf
format: text
identifier: http://digilib.unila.ac.id/75236/3/SKRIPSI%20TANPA%20%20BAB%20PEMBAHASAN.pdf
identifier:   Riski , Ade Soleh   (2023) OPTIMASI ANALISIS SNP (Single Nucleotide Polymorphism) GEN Disease Resistance Proteins RPS2 GENOM JAGUNG (Zea mays L.) 8 VARIETAS FASE PERKECAMBAHAN BERBASIS PCR (Polymerase Chain Reaction).  FAKULTAS PERTANIAN, UNIVERSITAS LAMPUNG.     
relation: http://digilib.unila.ac.id/75236/