%0 Generic
%A Fauziah Rizky, Nurfadillah
%C UNIVERSITAS LAMPUNG
%D 2024
%F eprints:81005
%I FAKULTAS PERTANIAN
%T DETEKSI SIMULTAN DAN VARIASI GENETIK BEBERAPA VIRUS YANG MENGINFEKSI TANAMAN CABAI RAWIT MENGGUNAKAN MULTIPLEX POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)
%U http://digilib.unila.ac.id/81005/
%X Cabai rawit (Capsicum frutescens L.) merupakan sayuran yang memiliki banyak manfaat serta bernilai ekonomis tinggi. Namun, akibat adanya infeksi virus menyebabkan terjadinya penurunan produksi. Selain itu, virus yang menginfeksi tanaman cabai rawit dapat lebih dari satu jenis virus atau infeksi campuran. Penelitian ini bertujuan untuk mendeteksi beberapa jenis virus yang menginfeksi tanaman cabai rawit di lapangan dengan Multiplex PCR menggunakan empat pasang primer dan mengetahui spesies virus serta variasi genetik virus yang menginfeksi tanaman cabai rawit. Survey lapangan dilakukan di Kabupaten Lampung Selatan, Provinsi Lampung. Empat sampel daun bergejala kerdil, keriting, menguning, dan daun menekuk ke atas diambil untuk dilakukan deteksi lebih lanjut di Laboratorium. Deteksi dilakukan berdasarkan Multiplex PCR menunjukkan cabai rawit terinfeksi Begomovirus dan Potyvirus dan tidak terinfeksi Cucumber mosaik virus dan Tomato infectious chlorosis virus. Hasil pohon filogenetik berdasarkan sekuen AC1/AC2 mengkonfirmasi bahwa Begomovirus isolat Lampung Selatan dengan Pepper yellow leaf curl Indonesia virus berasal dari tetua yang sama. Berdasarkan nilai homologi Begomovirus isolat Lampung Selatan dan PYLCV isolat Kertha memiliki nilai homologi 93% yang menunjukkan kedua virus termasuk ke dalam spesies yang sama strain yang berbeda. Hasil pohon gilogenetik berdasarkan sekuen coat protein mengkonfrmasi Potyvirus isolat Lampung Selatan dengan Potato virus Y memiliki kesamaan spesies. Potyvirus isolat Lampung Selatan dan PVY isolat Ukraina memiliki nilai homologi 100% yang menunjukkan bahwa Potyvirus Lampung Selatan dengan PVY Ukraine memiliki kesamaan yang spesifik. Hasil uji patogenesitas pada tanaman cabai rawit menunjukan gejala berupa mosaik ringan sampai mosaik berat.  Kata Kunci: Begomovirus, infeksi campuran, multiplex PCR, Potyvirus