<> "The repository administrator has not yet configured an RDF license."^^ . <> . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU)"^^ . "Gen esensial berperan penting dalam kelangsungan hidup organisme, dan\r\nidentifikasinya memiliki aplikasi luas dalam biologi sintetis dan medis. Namun,\r\nteknik eksperimental sering kali mahal dan rumit, sehingga metode komputasional\r\nberbasis pembelajaran mesin menjadi alternatif yang lebih efisien. Metode yang\r\ndigunakan adalah Bidirectional Gated Recurrent Unit (BiGRU) dengan\r\nmenggunakan Drosophila melanogaster sebagai organisme model. Tujuan dari\r\npenelitian ini adalah untuk mengevaluasi kinerja metode Bidirectional Gated\r\nRecurrent Unit (BiGRU) dalam sekuens protein pada Drosophila melanogaster.\r\nDataset yang digunakan diperoleh dari penelitian Beder, et al, (2021) dengan 2 jenis\r\ndataset yaitu Cellular Essential Gene (CEG) dan Organismal Essential Gene\r\n(OEG). Ada dua skema arsitektur model dan dua skenario pembagian data, yaitu\r\n80% training 20% validation dan 90% training 10% validation. Pada dataset CEG\r\nmemiliki distribusi kelas yang tidak seimbang sehingga dilakukan proses Random\r\nUndersampling (RUS). Hasil kinerja yang paling baik pada dataset OEG\r\ndidapatkan pada skenario pembagian data 80% training 20% validation dengan\r\nnilai yang didapat adalah 83 % sensitivitas, 79 % spesifisitas, 80% nilai ROC-AUC\r\ndan 85% nilai PR-AUC. Hasil yang paling baik pada dataset CEG diperoleh dari\r\npembagian data 90% training 10% validation dengan nilai yang didapat untuk\r\nsensitivitas adalah 73%, spesifisitas 55%, nilai ROC-AUC 64% dan nilai PR-AUC\r\n46%.\r\nKata Kunci: BiGRU, Drosophila melanogaster, Gen Esensial, Sekuens Protein.\r\n\r\nEssential genes play a crucial role in the survival of organisms, and their\r\nidentification has wide applications in synthetic biology and medicine. However,\r\nexperimental techniques are often expensive and complex, making computational\r\nmethods based on machine learning a more efficient alternative. The method used\r\nin this study is the Bidirectional Gated Recurrent Unit (BiGRU), with Drosophila\r\nmelanogaster as the model organism. The aim of this research is to evaluate the\r\nperformance of the BiGRU method in protein sequences of Drosophila\r\nmelanogaster. The dataset used was obtained from the study by Beder et al. (2021)\r\nand consists of two types of datasets: Cellular Essential Gene (CEG) and\r\nOrganismal Essential Gene (OEG). There are two model architecture schemes and\r\ntwo data-splitting scenarios: 80% training and 20% validation, and 90% training\r\nand 10% validation. The CEG dataset has an imbalanced class distribution, so\r\nRandom Undersampling (RUS) was applied. The best performance for the OEG\r\ndataset was achieved with the 80% training and 20% validation split, yielding 83%\r\nsensitivity, 79% specificity, 80% ROC-AUC, and 85% PR-AUC. The best\r\nperformance for the CEG dataset was obtained with the 90% training and 10%\r\nvalidation split, yielding 73% sensitivity, 55% specificity, 64% ROC-AUC, and\r\n46% PR-AUC.\r\nKeywords: BiGRU, Drosophila melanogaster, Essential Genes, Protein Sequence.\r\n"^^ . "2024-10-02" . . . . . "FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM"^^ . . . . . . . "DWI PUTRI"^^ . "YULIA "^^ . "DWI PUTRI YULIA "^^ . . . . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (File PDF)"^^ . . . "abstrak - Yulia Dwi Putri.pdf"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (File PDF)"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (File PDF)"^^ . . . "SKRIPSI tanpa pembahasan - Yulia Dwi Putri.pdf"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "indexcodes.txt"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "indexcodes.txt"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "lightbox.jpg"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "preview.jpg"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "medium.jpg"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "small.jpg"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "lightbox.jpg"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "preview.jpg"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "medium.jpg"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "small.jpg"^^ . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . . "KLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN\r\nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE\r\nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU) (Other)"^^ . . . . . "HTML Summary of #84494 \n\nKLASIFIKASI GEN ESENSIAL PADA SEKUENS PROTEIN \nDROSOPHILA MELANOGASTER MENGGUNAKAN METODE \nBIDIRECTIONAL GATED RECURRENT UNIT (BiGRU)\n\n" . "text/html" . . . "000 Ilmu komputer, informasi dan pekerjaan umum" . . . "005 Pemrograman komputer, program dan data" . . . "500 ilmu pengetahuan alam dan matematika" . .