%A  Febriansyah	 Muhammad
%T APLIKASI MOLEKULER DAN ANALISIS GENETIK SPESIES KOPI ROBUSTA
(Coffea canephora Pierre ex A. Froehner) PADA KTH MANDIRI JAYA,
GAPOKTANHUT LESTARI SEJAHTERA, KABUPATEN TANGGAMUS
%X Kabupaten Tanggamus merupakan salah satu Kabupaten di Lampung sebagai penghasil
kopi robusta terbesar di Indonesia. Lebih dari 50% penduduk Tanggamus menerapkan
perhutanan sosial, salah satunya Kelompok Tani Hutan (KTH), KTH Mandiri Jaya,
Gapoktanhut Lestari Sejahtera, di bawah binaan Kesatuan Pengelolaan Hutan (KPH)
Kota Agung Utara. Salah satu tugas utama adalah tata kelola kawasan, menjaga
keanekaragaman hayati. Informasi mengenai karakteristik genetik kopi robusta masih
terbatas, termasuk di Kabupaten Tanggamus. Dalam upaya pembangunan data dasar
plasma nutfah kopi robusta di KTH Mandiri Jaya, Gapoktanhut Lestari Sejahtera, KPHL
Kota Agung Utara, Kabupaten Tanggamus dengan melakukan konfirmasi spesies secara
molekuler menggunakan Polymerase Chain Reaction (PCR) dan analisis filogenetik.
Penelitian ini bertujuan untuk mengaplikasikan metode molekuler untuk konfirmasi
spesies kopi robusta dan menganalisis genetik spesies kopi robusta yang terdapat di KTH
Mandiri Jaya Gapoktanhut Lestari Sejahtera. Sampel yang digunakan adalah daun kopi
robusta yang diambil di area perkebunan KTH Mandiri Jaya, Gapoktanhut Lestari
Sejahtera, sedangkan untuk analisis molekuler menggunakan daun muda kopi robusta
dilaksanakan di Laboratorium Bioteknologi, Balai Veteriner Lampung. Penelitian ini
dilaksanakan dengan beberapa tahapan, yaitu ekstraksi DNA, amplifikasi DNA,
elektroforesis dan visualisasi DNA, sekuensing DNA, hasil sekuensing dianalisis dengan
uji BLAST. Berdasarkan uji BLAST diperoleh bahwa sampel kopi KTH Mandiri Jaya
terkonfirmasi sebagai spesies kopi robusta dengan memperoleh nilai query cover sebesar
97% dan nilai percentage identity sebesar 94,46%. Jarak genetik dan homologi antara
sekuens kopi robusta dengan sekuens sampel kopi KTH Mandiri Jaya berkisar antara 8,60
? 13,79 dan 86,21% ? 91,40%. Analisis dilanjutkan dengan mengkonstruksi pohon
filogenetik menggunakan software MEGA, diperoleh bahwa sekuens sampel kopi robusta
KTH Mandiri Jaya berada dalam satu klaster dari sekuens DNA Coffea canephora
lainnya.
Kata kunci: analisis genetik, aplikasi molekuler, BLAST, kopi robusta, KTH Mandiri
Jaya, perangkat lunak MEGA
%C UNIVERSITAS LAMPUNG
%D 2024
%I FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM
%L eprints85020