STUDI MOLECULAR DOCKING SENYAWA KOMPLEKS Cr(III)-ASPARTAT DAN Cu(II)-ASPARTAT TERHADAP PROTEIN 1Z12 SEBAGAI ANTIDIABETES

ANNISA, EKA YANTI (2023) STUDI MOLECULAR DOCKING SENYAWA KOMPLEKS Cr(III)-ASPARTAT DAN Cu(II)-ASPARTAT TERHADAP PROTEIN 1Z12 SEBAGAI ANTIDIABETES. FAKULTAS MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM , UNIVERSITAS LAMPUNG.

Preview	File PDF ABSTRAK.pdf Download (465Kb) | Preview
	File PDF SKRIPSI FULL.pdf Restricted to Hanya staf Download (4Mb) | Minta salinan
Preview	File PDF SKRIPSI TANPA BAB PEMBAHASAN.pdf Download (2865Kb) | Preview

Abstrak (Berisi Bastraknya saja, Judul dan Nama Tidak Boleh di Masukan)

Diabetes melitus (DM) merupakan penyakit kronis degeneratif yang ditandai dengan peningkatan kadar gula darah puasa ≥126 mg/dl. Salah satu mikronutrien yang efektif untuk memperbaiki kendali glukosa dan mencegah timbulnya komplikasi adalah kromium. Pada penelitian ini dilakukan molecular docking senyawa Cr(III)Aspartat dan Cu(II)Aspartat menggunakan software Plants. Validasi native ligand ion vanadat menunjukkan hasil RMSD sebesar 1.5934 Å dengan skor docking sebesar -45.3166. Docking senyawa Cr(III)Aspartat dan Cu(II)Aspartat dengan protein 1Z12 menunjukkan skor sebesar -33.9434 dan -53.4976 di mana skor docking Cu(II)Aspartat lebih negatif dari Cr(III)Aspartat. Visualisasi 2 dimensi Cr(III)Aspartat menggunakan software Ligpot memberikan hasil terdapat 6 asam amino yang sama dengan native ligand yang berikatan pada protein 1Z12 yaitu Cys12, Leu13, Gly14, Arg18, Cys17 , dan Ile16. Cu(II)Aspartat memberikan hasil 7 asam amino yang sama dengan native ligand yang berikatan pada protein 1Z12 yaitu Cys12, Arg18, Leu13, Gly14, Cys17, Ile16, dan Asn15. Visualisasi 3 dimensi Cu(II)Aspartat menggunakan software Pymol memberikan informasi panjang ikatan hidrogen antara N-O pada Cys17 sebesar 2.53 Å, sedangkan Cr(III)Aspartat sebesar 3.32 Å semakin pendek panjang ikatan yang terjadi menandakan ikatan yang terbentuk semakin kuat. Prediksi toksisitas dilakukan menggunakan Swissadme, Preadmet, dan Protox, pada Swissadme menunjukkan kedua senyawa memenuhi empat dari lima kriteria Lipinski’s Rule of Five. Hasil pada Preadmet menunjukkan Cu(II)Aspartat memilki nilai absorpsi sebesar 87.44% dan Cr(III)Aspartat sebesar 38.5 %. Uji toksisitas kedua senyawa pada Protox menunjukkan sifat inactive terhadap hepatotoxicity, carcinogenicity, immunotoxicity, mutagenicity, dan cytotoxicity yang berarti aman digunakan. Senyawa Cr(III)Aspartat dan Cu(II)Aspartat memiliki sifat farmakokinetika yang baik dengan skor docking Cu(II)Asparatat yang lebih negatif daripada skor docking Cr(III)Aspartat menunjukkan Cu(II)Asparatat lebih potensial sebagai antidiabetes daripada Cr(III)Aspartat secara uji in silico. Kata kunci : Molecular Docking, Cr(III)Aspartat, Cu(II)Aspartat, antidiabetes. Diabetes mellitus (DM) is a degenerative chronic disease characterized by an increase in fasting blood sugar levels ≥126 mg/dl. One of the effective micronutrients to improve glucose control and prevent complications is chromium. In this research, molecular docking of Cr(III)Aspartate and Cu(II)Aspartate compounds was carried out using Plants software. Validation of the native ligand vanadate ion showed RMSD result of 1.5934 Å with a docking score of -45.3166. The docking of Cr(III)Aspartate and Cu(II)Aspartate compounds with 1Z12 protein showed scores of -33.9434 and -53.4976 where the docking score of Cu(II)Aspartate was more negative than Cr(III)Aspartate. A 2-dimensional visualization of Cr(III)Aspartate using Ligpot software gives the result that there are 6 amino acids that are the same as the native ligand that binds to the 1Z12 protein, namely Cys12, Leu13, Gly14, Arg18, Cys17, and Ile16. Cu(II)Aspartate yields the same 7 amino acids as the native ligand that binds to the 1Z12 protein, namely Cys12, Arg18, Leu13, Gly14, Cys17, Ile16, and Asn15. The 3-dimensional visualization of Cu(II)Aspartate using Pymol software provides information on the length of the hydrogen bond between N-O in Cys17 of 2.53 Å, while for Cr(III)Aspartate of 3.32 Å the shorter the bond length, the stronger the bond formed. Toxicity prediction was carried out using Swissadme, Preadmet, and Protox, the Swissadme showed that the two compounds met four of the five Lipinski's Rule of Five criteria. The results on Predmet showed Cu(II)Aspartate had an absorption value of 87.44% and Cr(III)Aspartate of 38.5%. The toxicity test of the two compounds on the Protox shows that they are inactive towards hepatotoxicity, carcinogenicity, immunotoxicity, mutagenicity, and cytotoxicity which means they are safe to use. The Cr(III)Aspartate and Cu(II)Aspartate compounds have good pharmacokinetic properties with a more negative Cu(II)Aspartate docking score than Cr(III)Aspartate docking score indicating Cu(II)Asparatate is more potent as an antidiabetic than Cr(III)Aspartate by in silico test. Keywords : Molecular Docking, Cr(III)Aspartate, Cu(II)Aspartate, antidiabetic.

Jenis Karya Akhir:	Skripsi
Subyek:	500 ilmu pengetahuan alam dan matematika 600 Teknologi (ilmu terapan) > 660 Teknik kimia
Program Studi:	FAKULTAS MIPA > Prodi Kimia
Pengguna Deposit:	2301898066 . Digilib
Date Deposited:	31 May 2023 08:50
Terakhir diubah:	31 May 2023 08:50
URI:	http://digilib.unila.ac.id/id/eprint/71613

Actions (login required)

Lihat Karya Akhir